1998年11月25日，北京市人民政府正式向中国奥委会递交了申办2008年奥运会的申请书，1999年4月7日，经中国奥委会批准，北京市市长刘琪和中国奥委会主席伍绍祖飞赴位于瑞士洛桑的国际奥委会总部，向国际奥委会主席萨马兰奇递交了北京市申办2008年夏季奥运会的申办书。从此，北京加快了申办2008年奥运会的进程。在这个过程中，法轮功的主要破坏活动有：

　　2000年9月29日悉尼奥运会结束后，澳大利亚侨界为中国体育代表团举办了一场盛大的庆功会，声援和支持北京申办2008年奥运会。法轮功知道后向市政当局申请，妄图示威捣乱，遭到市政当局的严词拒绝。法轮功气急败坏，纠集几十人到会场外伺机滋事，受到市政官员和澳警方的警告，阴谋受挫。

　　2001年2月，北京市海淀区法轮功骨干邵某某等人，预谋向国际奥委会评估团进行法轮功反动宣传，以破坏北京奥运会申办活动。他们在境外法轮功组织的大力资助下，制作了大量英文宣传稿件和录音，企图利用小喇叭到国际奥委会评估团北京住地广播，被北京公安机关查获。

　　2001年3月，法轮功组织利用国际奥委会到加拿大考察的机会，在加拿大多伦多举行记者招待会，反对北京申办2008年奥运会，应者寥寥。

　　2001年7月，国际奥委会在莫斯科投票，法轮功组织又聚集莫斯科市进行集会捣乱、抗议示威，同时向国际奥委会委员发电子邮件进行骚扰和恐吓。当时，北京奥组委顾问何振梁透露：“有时一位奥委会委员每天可以收到近200封法轮功组织的电邮”，后被莫斯科警方驱散。

　　在申办过程中，法轮功邪教组织也积极投靠国际反华势力，并与“藏独”、“疆独”、“台独”、“民运”分子相勾结，制造国际社会对中国的偏见和仇视，扩大影响，挑起事端。2001年3月13日，多伦多“法轮功之友协会”召开记者招待会，表示“要向国际奥委会清楚地反映我们对中国政府残酷镇压法轮功学员、侵犯他(她)们的基本人权的深切关注，同时敦请国际奥委会维护奥林匹克精神和宪章。请国际奥委会和我们一道，严守奥运原则，维护人的基本人权，维护奥运精神。不能让中国举办2008年奥运会。”

　　同时，奥运会申办成功以前，他们在《明慧网》等麾下互联网上大量刊发反对北京申办“奥运会”的文章，如《俄克拉荷马日报：北京奥林匹克？天理难容！(免了吧！)》（明慧网2001年05月19日）、《致国际奥委会的一封信》（明慧网2001年6月27日）、《“让中国主办奥运会肯定会使北京政府更加残暴”》（明慧网2001年7月4日），《为什么中国不该赢得奥运会》（明慧网2001年7月11日），《大陆主办奥运有助提升国际地位无助改善人权》（明慧网2001年7月14日）等等100余篇，公开呼吁国际社会不要让北京取得2008年奥运会的主办权。

在申办过程中，法轮功邪教组织也积极投靠国际反华势力，并与“藏独”、“疆独”、“台独”、“民运”分子相勾结，制造国际社会对中国的偏见和仇视，扩大影响，挑起事端。